На его долю выпала тяжёлая военная судьба.
1282 стрелковый полк дивизии вместе с 1286 стрелковым полком 11 октября 1941 года был поставлен на пик прорыва из окружения у села Богородицкого.
В бою Борису осколком перебило ногу и в этот же день он попал в плен. Был определён в лазарет дулага №184 в Вязьме.
Вот как он сам описывал эти события:
«Госпиталь в Вязьме, куда я попал, находился недалеко от церкви, метрах в 300. До войны там, видимо, была школа, так как здание было похоже на школу – коридоры длинные и помещения, как для классов. Деревянная. В этом здании до прихода немцев размещался наш госпиталь. Не успел выехать. Весь персонал остался вместе с ранеными. Врачи, медсестры ходили в белых халатах, белых шапочках, косыночках. Как в СССР. Свет был, электричество. На кроватях оставались висеть таблички с именами раненых. Госпиталь не охранялся: больные все, лежачие, зима, куда денутся. Операции делали. Кормили сначала ничего. Суп, каша из концентратов. Когда лекарства кончились, а это произошло быстро, операции делали в живую. Меня оперировали без наркоза. Несколько месяцев я лежал только на спине, не мог перевернуться даже на бок – нога была закована в гипс, как в валенке. Сперва меня кормили медсестры. Раненые лежали в палате человек по 20. Помирало в госпитале много солдат, особенно раненных в живот, грудь. Кто выживал – тех отправляли в лагерь военнопленных. Из окна я видел, как наших на работу водили: одеты легко, а зима. Люди падали от истощения и болезней, кто встать не мог, тех немцы пристреливали. Ужас, сколько умирало.
Пробыл я в этом госпитале с октября 1941 по весну 1942 г. А в мае нас всех, кто мог ходить, под конвоем отправили на станцию Вязьма, и перевезли в шталаг Молодечно в Белоруссию. Там я опять попал в лазарет. Разговор был в Молодечно, что немцы хотели в здании госпиталя в Вязьме ремонт сделать и разместить там своих солдат. Всех неходячих вывезли и расстреляли, а врачей наших собрали и предложили им лечить немцев. Отказались наши. Немцы врачей тоже расстреляли, местные говорили.»
Из Молодечно Бориса Ивановича вывезли в лагерь военнопленных немецкого города Глайвиц (сейчас Гливи́це — город в Силезском воеводстве на юге Польши). Именно отсюда 1 сентября 1939 года, нападением гитлеровской Германии на Польшу, началась Вторая мировая война – самый кровопролитный и разрушительный вооружённый конфликт в истории человечества. 8 января 1944 года Шлячкова отправили в другой лагерь, в Чехию. По дороге он совершил побег и 17 января был уже зачислен в партизанский отряд, который позже вошел в состав партизанской бригады им. Яна Гуса, под командованием советского разведчика А.В. Фомина. Участвовал в освобождении городов Пардубицы, Праги и Голицы. 24 апреля партизаны соединились с войсками Красной Армии. Спецпроверку с 12 мая по 20 сентября 1945 года он прошел в 113 армейском запасном полку. После проверки служил в 127 авиационном полку и на военном складе №47.
20 февраля 1947 года был демобилизован. В апреле 1947 года вернулся на Московский электромашиностроительный завод. В 1957 году за участие в Великой Отечественной войне, полученное в бою ранение и участие в партизанской борьбе награжден Орденом отечественной войны 2 степени.
Борис Иванович Шлячков прожил долгую достойную жизнь. Старая рана под конец жизни болела, и он вынужден был ходить с палочкой. Много раз приезжал на Богородицкое поле, под Вязьму. Посещал установленный в память погибшим товарищам монумент.